根据《中华人民共和国企业所得税法》第六条规定：企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入，为收入总额。包括：（九）其他收入。

《企业所得税法》第八条规定企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，包括成本、费用、税金、损失和其他支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。

依据上述规定，企业内部的罚款收入应计入本单位收入，缴纳企业所得税。同时，与该项罚款收入有关的、合理的支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。

如果是购货方支付的违约金或因不遵守双方而产生的罚款，则属于价外费用，需要开具发票。

根据《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税〔2016〕36号)附件一第三十七条规定：“销售额，是指纳税人发生应税行为取得的全部价款和价外费用，财政部和国家税务总局另有规定的除外。