1、在取证方面：执业药师要高一个层次，执业药师是国家统一考试，全国范围都承认。药师证只是在省药监局组织考试，只有省内承认。

2、在认证方面：执业药师是从业资格。执业药师是指经全国统一考试合格，取得《执业药师资格证书》并经注册登记取得《执业药师注册证》，在药品生产、经营、使用单位中执业的药学技术人员。药学技术人员是指具有药学专业知识，取得药学专业技术职称并从事药学工作的技术人员。

3、在理论方面：执业药师是药学技术人员的一部分，药学技术人员不一定是执业药师，但执业药师一定是药学技术人员。

4、在职称方面：药师是属于职称，药师具体按专业不同分中药师、(西)药师，中药师与西药师都是药师，待遇都一样，只不过具体的专业不同。所谓的初级指的是职称，职称级别：初级、中级、副高、正高。

5、在晋升方面：中药师的晋升次序是：中药师、主管中药师、副主任中药师、主任中药师。(西)药师的晋升次序是：西药师、主管西药师、副主任西药师、主任西药师。中药师与西药师都属于初级职称。上下级药师之间在业务技术上有指导关系。

6、在药店编制方面：药店必须配备一名执业药师，若只卖西药，只需一名西药执业药师，若只卖中药，只需一名中药执业药师，若中西药都卖，不管你有没有西药执业药师，必须得有中药执业药师。